Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms