Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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