Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms