Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms