Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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