Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sfrp1Q8C4U3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfrp1Q8C4U3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 648.6 ms