Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms