Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kdm4aQ8BW72 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms