Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms