Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms