Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pcsk9Q80W65 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms