Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AknaQ80VW7 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms