Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms