Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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