Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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