Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casc4Q6P2L7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Casc4Q6P2L7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casc4Q6P2L7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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