Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms