Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms