Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slain1Q68FF7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slain1Q68FF7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slain1Q68FF7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slain1Q68FF7 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slain1Q68FF7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms