Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms