Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc1Q60596 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms