Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms