Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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