Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trp53i11Q4QQM4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms