Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf40Q3U319 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf40Q3U319 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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