Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sec24aQ3U2P1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms