Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Kdm4dQ3U2K5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Kdm4dQ3U2K5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kdm4dQ3U2K5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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