Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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