Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms