Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms