Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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