Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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