Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ptcd3Q14C51 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ptcd3Q14C51 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ptcd3Q14C51 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ptcd3Q14C51 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ptcd3Q14C51 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms