Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Traf3ip1Q149C2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Traf3ip1Q149C2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms