Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms