Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms