Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms