Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms