Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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