Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms