Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms