Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms