Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms