Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms