Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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