Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms