Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms