Protein–RNA interactions for Protein: P61620

Sec61a1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a1P61620 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61a1P61620 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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