Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Taf13P61216 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Taf13P61216 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Taf13P61216 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms