Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ppfia3P60469 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms